前作からあるAdventureモードやChallengeモード、Arcadeモードを搭載し、ワンカードあるいはマルチカードによるワイヤレスプレイが可能になっています。また、Simulatorモードで出現するミニゲームは、Challengeモード(難しいノルマが設定されています)のカテゴリをそれぞれクリアしていかなければアンロックされません。様々なメーカーの様々なクラシックゲームを参考にしている部分もあり、シューティングゲームファンなら思わず「ニヤリ」としてしまうかも。また、武器やオプションからのショット方向などを微調整することも可能です。オプションですが、これは「敵の弾を防御しない」ので注意!何度もプレイする気を起こさせる秀逸なタイトルです(難易度は高めです)。
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